Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip11E9Q512 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trip11E9Q512 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip11E9Q512 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip11E9Q512 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2145.2 ms