Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rsf1E9PWW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rsf1E9PWW9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Rsf1E9PWW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rsf1E9PWW9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Rsf1E9PWW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms