Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Trappc8E9PWG2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trappc8E9PWG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trappc8E9PWG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Trappc8E9PWG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Trappc8E9PWG2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms