Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Vpreb3D3Z6J4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms