Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4N8

Vmn2r72, Vomeronasal 2, receptor 72, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r72D3Z4N8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r72D3Z4N8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r72D3Z4N8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r72D3Z4N8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r72D3Z4N8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r72D3Z4N8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms