Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6685D3YYP3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6685D3YYP3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6685D3YYP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6685D3YYP3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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