Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SafbD3YXK2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SafbD3YXK2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SafbD3YXK2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SafbD3YXK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms