Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx8D3YU81 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx8D3YU81 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rfx8D3YU81 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms