Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm6133B2RY53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6133B2RY53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm6133B2RY53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1018.7 ms