Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hbb-bh2B2RVB7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hbb-bh2B2RVB7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms