Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AU015836B2RUM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AU015836B2RUM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AU015836B2RUM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms