Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprbB2RU80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprbB2RU80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprbB2RU80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprbB2RU80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms