Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp40B1B1D3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp40B1B1D3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms