Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtpruB1AUH1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtpruB1AUH1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtpruB1AUH1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtpruB1AUH1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms