Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms