Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skint2A7XUX6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skint2A7XUX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skint2A7XUX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms