Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp2c2A7L9Z8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2c2A7L9Z8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms