Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt1lA2RSY6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt1lA2RSY6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trmt1lA2RSY6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms