Protein–RNA interactions for Protein: A2APB8

Tpx2, Targeting protein for Xklp2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpx2A2APB8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpx2A2APB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tpx2A2APB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpx2A2APB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpx2A2APB8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpx2A2APB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms