Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syndig1A2ANU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syndig1A2ANU3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms