Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd7A2AJK6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd7A2AJK6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms