Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm884A2A9H6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm884A2A9H6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm884A2A9H6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms