Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ino80eA0A0U1RP99 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80eA0A0U1RP99 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 553.6 ms