Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms