Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdfS4R2K0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdfS4R2K0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdfS4R2K0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms