Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngr4Q9Z1L2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngr4Q9Z1L2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngr4Q9Z1L2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syngr4Q9Z1L2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms