Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb6Q9Z0T9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb6Q9Z0T9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms