Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn9Q9Z0S7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn9Q9Z0S7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn9Q9Z0S7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms