Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited4Q9WUL8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cited4Q9WUL8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited4Q9WUL8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms