Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx9Q9WUH2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx9Q9WUH2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lhx9Q9WUH2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx9Q9WUH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms