Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pus1Q9WU56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus1Q9WU56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus1Q9WU56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms