Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lemd3Q9WU40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lemd3Q9WU40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Lemd3Q9WU40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Lemd3Q9WU40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms