Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul1Q9WTX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul1Q9WTX6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul1Q9WTX6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul1Q9WTX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul1Q9WTX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms