Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc6Q9R1S7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Abcc6Q9R1S7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Abcc6Q9R1S7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc6Q9R1S7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc6Q9R1S7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Abcc6Q9R1S7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms