Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syt6Q9R0N8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt6Q9R0N8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syt6Q9R0N8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms