Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AmfrQ9R049 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AmfrQ9R049 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AmfrQ9R049 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms