Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf25Q9QZR0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf25Q9QZR0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf25Q9QZR0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf25Q9QZR0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf25Q9QZR0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf25Q9QZR0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf25Q9QZR0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf25Q9QZR0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf25Q9QZR0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms