Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk1nQ9QXV0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk1nQ9QXV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcsk1nQ9QXV0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms