Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS1

Plec, Plectin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 4,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlecQ9QXS1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PlecQ9QXS1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlecQ9QXS1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlecQ9QXS1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlecQ9QXS1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms