Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Homer2Q9QWW1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Homer2Q9QWW1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer2Q9QWW1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer2Q9QWW1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.8 ms