Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dkk3Q9QUN9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dkk3Q9QUN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms