Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdgfl3Q9JMG7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms