Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc2lQ9JME7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms