Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc42ep4Q9JM96 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc42ep4Q9JM96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42ep4Q9JM96 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.3 ms