Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrfQ9JM73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrfQ9JM73 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrfQ9JM73 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms