Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabgef1Q9JM13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabgef1Q9JM13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabgef1Q9JM13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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