Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alyref2Q9JJW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Alyref2Q9JJW6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms