Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog8Q9JJA2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog8Q9JJA2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog8Q9JJA2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog8Q9JJA2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms