Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtsrQ9JIA9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsrQ9JIA9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsrQ9JIA9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsrQ9JIA9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms