Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LratQ9JI60 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LratQ9JI60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LratQ9JI60 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LratQ9JI60 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LratQ9JI60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LratQ9JI60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LratQ9JI60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LratQ9JI60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LratQ9JI60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LratQ9JI60 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LratQ9JI60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LratQ9JI60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LratQ9JI60 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LratQ9JI60 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LratQ9JI60 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LratQ9JI60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LratQ9JI60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LratQ9JI60 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LratQ9JI60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LratQ9JI60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LratQ9JI60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LratQ9JI60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LratQ9JI60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LratQ9JI60 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LratQ9JI60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LratQ9JI60 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms