Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmod3Q9JHJ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod3Q9JHJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmod3Q9JHJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod3Q9JHJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod3Q9JHJ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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